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| Code | Nom commun | Nom scientifique | Fiche PDF |
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Amphibiens et Reptiles |
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| 1995 | Lézard montagnard des Pyrénées | Lacerta bonnali |
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Invertébrés |
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| 1071 | Fadet des laîches | Coenonympha oedippus | fiche 1071 |
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| 1079 | Grand Capricorne | Cerambyx cerdo | fiche 1079 | |
| 1083 | Lucane cerf-volant | Lucanus cervus | fiche 1083 |
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| 1087 | Rosalie des Alpes | Rosalia alpina | fiche 1087 |
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Mammifères |
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| 1308 | Barbastelle | Barbastella barbastellus | fiche 1308 |
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| 1301 | Desman des Pyrénées Photo réalisée sur l'Oussouet par © Jean-Luc Cazaux, Contrat de Rivière du Haut-Adour |
Galemys pyrenaicus | fiche 1301 |
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| 1324 | Grand Murin | Myotis myotis | fiche 1324 |
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| 1304 | Grand Rhinolophe | Rhinolophus ferrumequinum | fiche 1304 | |
| 1355 | Loutre d'Europe | Lutra lutra | fiche 1355 |
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| 1310 | Minioptère de Schreibers | Miniopterus schreibersi | fiche 1310 |
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| 1307 | Petit Murin | Myotis blythi | fiche 1307 | |
| 1303 | Petit Rhinolophe | Rhinolophus hipposideros | fiche 1303 |
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| 1305 | Rhinolophe euryale | Rhinolophus euryale | fiche 1305 | |
| 1321 | Vespertilion à oreilles échancrées | Myotis emarginatus | fiche 1321 | |
Oiseaux |
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| A092 | Aigle botté | Hieraetus pennatus | fiche A092 |
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| A091 | Aigle royal | Aquila chrysaetos | fiche A091 |
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| A338 | Chouette de Tengmalm | Aegolius funereus | fiche A338 |
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| A080 | Circaète Jean-le-blanc | Circaetus gallicus |
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| A346 | Crave à bec rouge | Pyrrhocorax pyrrhocorax | fiche A346 |
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| A080 | Faucon pèlerin | Falco peregrinus | fiche A080 |
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| A108 | Grand Tétras | Tetrao urogallus | fiche A108 |
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| A127 | Grue cendrée | Grus grus | fiche A127 |
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| A076 | Gypaète barbu | Gypaetus barbatus | fiche A076 |
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| A215 | Hibou Grand Duc | Bubo bubo | fiche A215 | |
| A106 | Lagopède alpin des Pyrénées | Lagopus mutus pyrenaicus | fiche A407 |
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| A282 | Merle à plastron | Turdus torquatus | fiche A282 |
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| A280 | Monticole de roche | Monticola saxatilis | fiche A280 |
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| A415 | Perdrix grise des Pyrénées | Perdrix perdrix hispaniensis | fiche A415 |
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| A239 | Pic à dos blanc | Dendrocopos leucotos | fiche A239 |
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| A238 | Pic mar | Dendrocopos medius | fiche A238 |
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| A236 | Pic noir | Dryocopus martius | fiche A236 |
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| A338 | Pie-grièche écorcheur | Lanius collurio | fiche A338 |
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| A077 | Vautour percnoptère | Neophron percnopterus | fiche A077 |
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Poissons |
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| 1106 |
Saumon atlantique |
Salmo salar | fiche 1106 |
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Végétaux |
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| 1632 | Androsace des Pyrénées | Androsace pyrenaica | fiche 1632 | |
| 1802 | Aster des Pyrénées | Aster pyrenaeus | fiche 1802 |
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| 1386 | Buxbaumie verte | Buxbaumia viridis | fiche 1386 | |
| 1393 | Drépanoclade brillant | Drepanocladus vernicosus | fiche 1393 | |
| 1387 | Orthotric de Roger | Orthotricum rogeri | fiche 1387 | |
