| Code | Nom commun | Nom scientifique | Lien Portail Natura 2000 |
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| Amphibiens et Reptiles | ||||
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1995 |
Lézard montagnard des Pyrénées | Ibolacerta bonnali |
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| Invertébrés | ||||
| 1071 | Fadet des laîches | Coenonympha oedippus | page 1071 |
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| 1079 | Grand Capricorne | Cerambyx cerdo | page 1079 | |
| 1083 | Lucane cerf-volant | Lucanus cervus | page 1083 |
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| 1087 | Rosalie des Alpes | Rosalia alpina | page 1087 |
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| Mammifères | ||||
| 1308 | Barbastelle | Barbastella barbastellus | page 1308 |
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| 1301 | Desman des Pyrénées |
Galemys pyrenaicus | page 1301 |
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| 1324 | Grand Murin | Myotis myotis | page 1324 |
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| 1304 | Grand Rhinolophe | Rhinolophus ferrumequinum | page 1304 | |
| 1355 | Loutre d'Europe | Lutra lutra | page 1355 |
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| 1310 | Minioptère de Schreibers | Miniopterus schreibersi | page 1310 |
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| 1307 | Petit Murin | Myotis blythi | page 1307 | |
| 1303 | Petit Rhinolophe | Rhinolophus hipposideros | page 1303 |
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| 1305 | Rhinolophe euryale | Rhinolophus euryale | page 1305 | |
| 1321 | Vespertilion à oreilles échancrées | Myotis emarginatus |
page 1321 | |
| Oiseaux | ||||
| A092 | Aigle botté | Hieraetus pennatus |
page A092 |
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| A091 | Aigle royal | Aquila chrysaetos |
page A091 |
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| A338 | Chouette de Tengmalm | Aegolius funereus |
page A338 |
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| A080 | Circaète Jean-le-blanc | Circaetus gallicus |
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| A346 | Crave à bec rouge |
Pyrrhocorax pyrrhocorax | page A346 |
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| A080 | Faucon pèlerin | Falco peregrinus |
page A080 |
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| A108 | Grand Tétras | Tetrao urogallus |
page A108 |
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| A127 | Grue cendrée | Grus grus | page A127 |
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| A076 | Gypaète barbu | Gypaetus barbatus |
page A076 |
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| A215 | Hibou Grand Duc |
Bubo bubo | ||
| A106 | Lagopède alpin des Pyrénées |
Lagopus mutus pyrenaicus | page A407 |
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| A282 | Merle à plastron |
Turdus torquatus |
page A282 |
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| A280 | Monticole de roche |
Monticola saxatilis |
page A280 |
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| A415 | Perdrix grise des Pyrénées |
Perdrix perdrix hispaniensis | page A415 |
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| A239 | Pic à dos blanc | Dendrocopos leucotos | page A239 |
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| A238 | Pic mar | Dendrocopos medius | page A238 |
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| A236 | Pic noir | Dryocopus martius |
page A236 |
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| A338 | Pie-grièche écorcheur | Lanius collurio |
page A338 |
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| A077 | Vautour percnoptère |
Neophron percnopterus | page A077 |
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| Poissons | ||||
| 1106 |
Saumon |
Salmo salar | page 1106 |
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| Végétaux | ||||
| 1632 | Androsace des Pyrénées |
Androsace pyrenaica | page 1632 | |
| 1802 | Aster des Pyrénées |
Aster pyrenaeus | page 1802 |
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| 1386 | Buxbaumie verte | Buxbaumia viridis |
page 1386 | |
| 1393 | Drépanoclade brillant | Drepanocladus vernicosus | page 1393 | |
| 1387 | Orthotric de Roger |
Orthotricum rogeri |
page 1387 | |
